Nukleinsav festékek

Bővebben a Biotium weboldalon

GelRed és GelGreen fluoreszcens nukleinsav festékek - az új generáció

A GelRed és GelGreen új generációs fluoreszcens, alacsony toxicitású, nagy érzékenységű interkalálódó nukleinsav festékek. Specifikusan kötik a dsDNS-t, ssDNS-t és az RNS-t. Széles körben alkalmazhatóak különböző gél alapú elválasztási technikáknál (pl. DGGE, EMSA, PFGE) és egyéb módszereknél (COMET assay). Előnyük az EtBr-dal és más fluoreszcens festékekkel (SYBR Safe) szemben a nagyfokú érzékenység és minimális háttér a detektálás során (1.ábra). Rendkívül környezetbarát, amit a biztonságosságát vizsgáló teszt is alátámasztott (EPA regulated Title 22 test). Az EtBr felhasználása teljes mértékben kiváltható, nem igényel külön kezelést és ártalmatlanítási eljárást. 

1. ábra A GelRed és a GelGreen összehasonlítása SYBRSafe és EtBr festékekkel 1 %-os agaróz gélben. Mintaként különböző mennyiségű (200, 100,50,25 ng) 1 kb-os DNS-létrát használtak.

További előnyük az EtBr-al szemben, hogy a felmelegített agaróz gélhez azonnal (saját tapasztalataink ezt megerősítik: akár forralás után közvetlenül) hozzáadhatóak. Mivel a futtatás során nem diffundálnak ki a gélből, ezért a futtató pufferhez nem szükséges külön hozzáadni. A gyártó, a Biotium mindkét festék esetében a futtatás utáni festést javasolja, mivel a DNS-kötő festékek megváltoztatják a fragmensek futási tulajdonságait. Ez természetesen minden ilyen alkalmazott festék esetében felmerül, de tekintve, hogy a létrával is ez történik, a gélben festés esetén sem zavart a fragmens méretének meghatározása.

   A GelRed és EtBr gerjesztési-emissziós tulajdonságai megegyeznek, ezért az EtBr detektálásához használt berendezések a GelRed detektálásához felhasználhatóak. A GelGreen festékhez kétféle gerjesztési hullámhossz tartozik: egy gyengébb 250-300nm között és egy erősebb 500nm körül. Emissziós hullámhossza is eltér a GelRed festékétől (2.ábra). A GelGreen festék spektrális tulajdonságai leginkább a SYBR Safe-hez hasonlíthatóak, ezért az ehhez használható detektáló berendezések megfelelőek a GelGreen festék esetén is .

2. ábra A GelRed és a GelGreen gerjesztési és emissziós spektrumai foszfátpufferbenben oldott dsDNS esetén.

A GelRed és GelGreen nukleinsav festékek tulajdonságai: sejtmembrán impermeábilitás – teljes felhasználói biztonság, nem veszélyezteti a kutató egészségét kiváló érzékenység és stabilitás – nagyobb érzékenységű és fotóstabilabb az EtBr-nál és a SYBR Safe-nél széleskörű műszer kompatibilitás további eljárásokkal való kompatibilitás használható bármilyen kereskedelemben kapható nukleinsav létrával a géleket öntés előtt vagy után is festhetjük a gélek újra használhatóak (hasonlóan a hagyományos EtBr gélekhez), ha üres zsebek voltak előző futtatáskor nem igényel speciális hulladékgyűjtést, egyszerűen kiönthető, illetve kidobható   A kit kiszerelés további előnyei: elérhető kit kiszerelésben is – tartalma: 6X loading puffer 2 tracking festékkel együtt, running puffer gyors, akár fele annyi ideig tartó futtatás – a kitben található speciális loading és running puffereknek köszönhetően 100 minigélre elegendő reagens a kitben (loadig és running puffer) gyors, egyszerű felhasználás – kiváló érzékenység, biztonság

 
GelRed és GelGreen festékek terméklistája: